消化科，是福建省中医药学会脾胃分会副主任委员单位，福建省中西医结合学会消化系统疾病分会副主任委员单位，中华医学会福建省消化病分会委员单位，世界中医药学会联合会消化病分会理事单位，中国民族医药学会脾胃病分会理事单位，福建中医药大学中西医结合硕士培养点，是福建省中医、中西医结合脾胃病科的龙头之一。科室坚持中医为主导、中西医结合，开展消化系统疾病的诊断治疗、临床教学和科研工作。

科室由专科门诊、专科病房、陈长华全国名老中医传承工作室、陈长华福建省名中医工作室、消化功能检测室组成，现有医师15人，其中主任医师5人，副主任医师3人，主治医师6人，住院医师1人。开放床位32张，配置胃肠动力治疗仪、电子针疗仪、腿浴治疗器、中频治疗仪、针灸手法诊疗仪等中医诊疗设备，开展生物电反馈、红外线、中药热奄包、中药贴敷、中药涂擦、针灸等治疗。开展幽门螺旋杆菌检测、胃肠电生理检测、胶囊内镜、电子胃镜、电子结肠镜等内镜下检查及治疗。自主研发藿砂口服液、胃炎胶囊、五倍子液、白芨胶浆和健脾和胃膏等中药制剂，临床疗效好、副作用低，深受患者的喜爱。在食管、胃、肠、肝、胆、胰腺等疾病，尤其对慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡、功能性胃肠疾病、炎症性肠病、急慢性胰腺炎、急慢性肝炎等疾病治疗上，注重中医辨证论证，同时结合现代医学先进的诊断治疗方法，疗效显著，获得患者及家属的好评。