福建中医药大学附属人民医院肿瘤科是全国高科技健康产业工作委员会胃肠肿瘤防治委员会主任委员单位。拥有60张床位，技术力量雄厚，医师16人，其中主任医师3人，副主任医师4人，内设：颈部、胸部、腹部、乳腺等肿瘤的规范化分组,开展标准化手术和胸、腹腔镜微创性手术，内科化疗，体内伽玛刀植入放射治疗，高能超声聚焦刀治疗，并与影像科、病理科、放射治疗科有机融合形成高度专业结构整合的梯队。

专科以“提高肿瘤患者的生存率与生存质量”作为科室发展目标，提高核心竞争力。

总结40年5000多例胃肠癌手术治疗经验，率先在国内开展胃肠癌的数字手术病理，相继于2008年与2009年由中华医学会组织的全国性学术会议推广应用。率先在国内开展胃肠癌亚临床癌的区域性根治性的新辅助化疗，率先在国内开展一期、二期胃肠癌手术综合治疗五年以上生存率的承诺性举措，生存率达领先水平；食管癌开展功能性三野根治手术，生存率进一步提高；卫生部指定的开展高能超声聚焦刀治疗胰腺癌等肿瘤的单位（科室）。开展甲状腺癌改良根治术近1000例，结节性甲状腺肿、腺瘤等手术复发率低。开展乳腺癌根治术、改良根治术与保乳手术及乳房再造术。

专科注重中西医结合，配合中医中药治疗肿瘤，减轻痛苦，提高生活质量，延长生存期。