招标采购
我院拟委托一名供应商提供小鼠空间转录组检测服务。现将调研事宜公告如下,欢迎具有相关资质的单位前来递交调研文件。
一、采购要求和范围
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物种/样本来源 |
产品 |
数量 |
数据量 |
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小鼠 |
空间转录组 |
12 |
1000M |
样品检测合格后采取以下技术路线进行高精度空间转录组测序: 高精度空间转录组样品制备——组织优化――表达实验及文库构建——上机测序――生物信息学分析。
1.主要进行以下检测分析:
1.1分析条目
1.测序数据统计与评估
1)数据质控
2)数据定量
3)基因表达定量
4)Square bin 统计及最优 bin 策略选择
5)图像识别、配准、分割和 Cell bin 统计
2.bin 聚类分析
1)低质量 bin 过滤
2)bin 聚类结果统计
3)各样本在各亚群 bin 数量统计
4)基因在各个 bin 亚群表达量均值统计
5)分群结果可视化
3.亚群上调基因分析
1)上调表达基因筛选
2)上调表达基因 GO 功能富集分析
3)上调表达基因 KEGG 功能富集分析
4)上调表达基因 DO 功能富集分析(仅限人)5)上调表达基因 Reactome 功能富集分析(仅限人、大鼠、小鼠)
4.亚群特征基因分析
1)亚群特征基因筛选
2)亚群特征基因表达分布
3)亚群特征基因蛋白质互作网络分析
1.2在线报告分析
1.Spot 分组方案
2.基因集筛选
1)聚类基因集筛选
2)目标基因集筛选
3.Spot 亚群分类分析
1)SPOT 频率分析
2)组织映射图(亚群信息、转录本(UMI)信息)
3)分类 tSNE 图(亚群信息、样本信息、转录本(UMI)信息)
4)分类 UMAP 图(亚群信息、样本信息、转录本(UMI)信息)
4.基因分布查看
1)组织映射图(表达量、分类)
2)基因 tSNE 图(表达量、分类)
3)基因 UMAP 图(表达量、分类)
4)基因小提琴图
5)基因气泡图
6)基因热图
5.亚群上调基因分析
1)亚群上调统计柱状图
2)亚群上调基因分布
3)上调差异基因 GO 富集
4)上调差异基因 KEGG 富集
6.空间通讯分析(仅限人、小鼠)
1)细胞互作分析
2)配受体对分析
7.组间差异分析
1)差异基因统计
2)差异基因分布
3)差异基因 GO 富集
4)差异基因 KEGG 富集
5)GSEA 分析
2、各方工作内容及进度安排
2.1 供应商
1.供应商在收到院方样品及送样单后开始样品检测。
2.项目周期以样品检测合格后开始计算:30 个样本以内,周期为 45 个工作
日,样本数每增加 10 个,周期增加 3 个工作日;供应商需在项目周期内(五一、十 一等国家法定节假日不计入)完成全部测序及测序数据的处理工作。
3.若在测序或数据处理中遇到技术障碍,供应商应与院方及时沟通,双方沟
通时间应从本条第二点中的工作日中扣除。
4.若因样品送样单、样品关系单等需要院方提供的信息不及时发送或信息
有误所造成的耽误时间,应从上述第二点中的工作日中扣除。
5.如试验过程院方因实际需要而增加样本数量或检测数据量,经供应商确认
双方完成协议内容变更,技术服务费用按照实际的样本数量和检测数据量进行
计算。院方需按照供应商要求支付技术服务费差额,差额支付后,供应商将完整的数据和报告全部交给院方。如院方未按规定时间支付差额费用,供应商不承担因此导致的项目延期、成果交付迟延等责任。
6.对于检测不合格的样品,如需保存,院方应在收到样品检测报告后 7 天
内与供应商联系,并发送《返样单》。如院方逾期未与供应商联系或返样单不到
位,该不合格逾期样品会在样品检测报告发出后的 7 天后进行销毁。对于完成
测序分析,剩余样本需要返还的项目,院方需要在收到项目完整版结题报告 1
个月内提出,发送《返样单》,同时支付返样所需的干冰及快递费用。院方逾
期未与供应商联系或返样单不到位,样本将进行销毁。
7.供应商在向院方提供项目结果和报告后,原始测序数据保留数据的时间为
三个月。对于合同中涉及在线报告的项目,供应商将免费提供院方本合同中所涉及项目的在线报告 2 年使用权限(从项目结题报告交付开始计算),并约定续期方案如下:
1)在使用权限到期前 6 个月以内,供应商将向院方联系邮箱至少发送一次
在线报告使用权限到期提醒,提醒院方申请使用权限延期或者及 时备份个人数据。
2)院方如有延期需求,则须在使用权限到期前联系供应商,申请使用权限延期并支付相应费用。
3)院方如没有延期计划但有数据备份需求,则须在使用期限到期前联系供应商,
从账户中拷贝取回个人账户数据。
4)对于使用权限到期的项目,供应商将删除项目数据,不再提供数据保管服务。
3、成果交付
供应商在项目完成之后向院方邮箱发送结题报告并视为送达;院方在收到结
题报告后 90 天内,如无反馈视为对本项目交付结果满意(院方邮箱以合同院方
指定邮箱为准,院方反馈邮箱以供应商发送结题报告的邮箱为准)。测序过程中
产生的序列文件*.fq 和相关生物信息分析结果文件,可通过网络传输或院方自
行提供 U 盘或移动硬盘传输。供应商确保提交符合合同约定的数据量给院方。考虑到生物学实验的不确定性,即在各样本总数据量达标的情况下,每个样本数据量不低于目标数据量的 90%,平均 Q20≥90%,平均 Q30≥80%。如果实际测序产生的数据量超出合同约定的数据量,供应商将所有下机数据全部提交给院方,供应商提交给院方的信息分析结果将基于所有提交给院方的数据。
双方确定,按以下标准及方法对供应商完成的研究开发成果进行验收:对于
提供的基因组测序深度,测序数据质量,数据分析结果全部达到合同规定标准,并得到院方确认。
付款方式:
双方合同签订后,院方以对公转账的方式支付合同总金额50%给供应商,待所有服务完成后,经院方验收无误后,院方支付剩余50%款项。
二、调研文件要求
请按以下顺序装订材料并密封,每页加盖公章。
1、报价表;
2、营业执照复印件;
3、法定代表人授权委托书原件并加盖公章(供应商是法定代表人的无需提供);
4、法定代表人及投标代表的有效身份证复印件。
5、服务承诺
6、相关资质证明
三、市场调研接收材料时间
2026年4月20日-2026年4月24日8:30-11:30,14:30-16:30(周末及法定节假日除外)
四、报名要求:将纸质采购材料装订密封后递交至福建省福州市台江区八一七中路602号省人民医院6号楼二层后勤处办公室。
五、联系人:廖先生 0591-83947229
六、本公告同时在福建中医药大学附属人民医院院内、院外网上发布。
福建中医药大学附属人民医院
2026年4月17日












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